1983
南京财贸学院
南京市香铺营（筹建阶段借址财贸干校上课）
1984
南京财贸学院
南京市香铺营 1985年10月迁址南京市凤凰西街239号（院北门）
南京市人民政府管理
1987
南京审计学院
南京市凤凰西街239号
1987年更名为南京审计学院，实行审计署、江苏省、南京市共管，以审计署为主的管理体制
1990
南京审计学院
南京市北圩路77号
1991年成为部属院校，实行审计署管理，审计署、江苏省共建
1993
南京审计学院
南京市北圩路77号
1993年升格为本科院校
2000
南京审计学院
莫愁校区：南京市北圩路77号
2000年3月学校体制改革划归江苏省管理，实行江苏省、审计署共建
2002
南京审计学院
莫愁校区：南京市北圩路77号
浦口校区：南京市浦口区江浦街道雨山西路86号
2002年南京金融高等专科学院并入南京审计学院
（南京金融高等专科学校沿革：1951年苏北银行学校 扬州市
1952年华东银行学校 苏州市
1978年江苏银行学校 南京江浦
1984年南京金融高等专科学校 南京江浦）
2010
南京审计学院
莫愁校区：南京市北圩路77号
浦口校区：南京市浦口区江浦街道雨山西路86号
2010年成为硕士授权立项建设单位
2011
南京审计学院
莫愁校区：南京市北圩路77号
浦口校区：南京市浦口区江浦街道雨山西路86号
2011年8月学校实行审计署、教育部、财政部、江苏省“三部一省”共建